BIOMNIGENE - La biologie moléculaire pensée pour vos besoins

Nous sommes dans la capacité d’extraire le matériel génétique (ADN ou ARN) dont vous avez besoin pour la réalisation de vos analyses à partir de tout type d'échantillon : tissus divers (sang, peau, ...) culots cellulaires (eucaryotes ou procaryotes) prélèvements environnementaux ( eau, terre, …) fèces.... Afin de garantir une extraction optimale, nous utilisons la méthode la plus adaptée suivant le type d'échantillon fourni. Quel que soit la méthode utilisée, les grandes étapes de la préparation sont les suivantes : Lyse : mécanique, chimique ou enzymatique suivant la nature du prélèvement Isolement de l'ADN ou de l'ARN : sur colonne de silice ou par centrifugation différentielle Purification : élution de la colonne après élimination des protéines et autres contaminants Contrôle qualité (optionnel) : dosage par spectrophotométrie ou visualisation du profil électrophorétique sur gel d'agarose. L’ADN ou l’ARN extrait est repris dans de l’eau ultrapure ou du tampon d'élution...

Vous souhaitez : déterminer une séquence pour identifier des mutations (mutations ponctuelles (SNPs), insertions, délétions) évaluer les liens de parenté entre individus ou populations mettre en évidence la présence d'un organisme donné dans un échantillon biologique réaliser un clonage dans un vecteur d'expression pour la synthèse d'une protéine recombinante... Ces analyses requièrent généralement une amplification de matériel génétique par une réaction enzymatique appelée PCR (Polymerase Chain Reaction). Cette réaction est généralement réalisée à partir d'ADN. Pour certaines applications spécifiques, on utilise comme matériel de départ de l'ADNc obtenu par transcription inverse d'ARN. Principe de la méthode Les molécules d'ADN, dans leur état naturel, sont constituées de deux brins complémentaires. Le passage à une température supérieure à 94 °C entraîne la séparation des deux brins de l'ADN et la destruction des structures secondaires (étape de dénaturation). Les molécules...

Vos projets de recherche nécessitent de : Quantifier l' expression d'un gène Détecter et estimer la quantité relative d'un pathogène, un virus ... Génotyper à partir de SNPs Détecter et déterminer le nombre de copies d'un gène Contrôler la qualité de vos cocultures et valider un test de production. La PCR en temps réel ou PCR quantitative (qPCR) est une des techniques les plus adaptées pour répondre à ces besoins : dérivée de la PCR, elle permet de détecter, caractériser et quantifier les acides nucléiques pour de nombreuses applications. La qPCR est généralement réalisée à partir d'ADN, mais pour certaines applications spécifiques telles que l' expression de gènes, l'ARN sera utilisé comme support de départ, nous parlons alors de RT-qPCR (Reverse Transcription quantitative PCR). Plus précisément, la PCR en temps réel diffère de la PCR classique par l'utilisation d'un système de marquage permettant de suivre la progression de la réaction. Les données recueillies à chaque cycle...

Vous souhaitez : Connaître les prédispositions génétiques de votre animal de compagnie à certaines maladies Confirmer la couleur de robe de votre poulain ou vérifier la présence ou l'absence de cornes sur vos veaux dans le cadre d'une amélioration de race Vérifier la présence d'un insert dans un plasmide Chercher la présence de mutations impliquées dans les mécanismes de résistances aux antibiotiques ou antifongiques chez des micro-organismes Déterminer la séquence d'un ou plusieurs gènes cibles pour des études de filiation ou de génotypage Réaliser une sauvegarde de la séquence d'un anticorps présentant un intérêt pharmaceutique... Le séquençage par la méthode Sanger qui permet de déterminer l’enchaînement des bases d'une séquence courte d'ADN est une des techniques couramment utilisées pour répondre à ces besoins. Principe de la méthode Cette technique de séquençage de l'ADN, également appelée "séquençage par terminaison de chaîne" ou "séquençage déoxy" ...

Le séquençage de nouvelle génération nécessite une préparation soigneuse du matériel génétique en amont de la réaction de séquençage pour garantir des résultats fiables. Le séquençage haut débit est réalisé sur des fragments de taille homogène présentant à leurs extrémités de courtes séquences appelées étiquettes permettant de définir l'origine des fragments lors du séquençage simultanée de plusieurs échantillons, la fixation sur un support solide et l'initialisation de la réaction de séquençage par incorporation de dNTPs marqués. Pour générer ces fragments qui constituent ce que l'on appelle une librairie, il existe différentes approches comme par exemple : La préparation de librairies par fragmentation : le matériel génétique est dans un premier temps découpé en fragments de différentes tailles. La fragmentation peut être mécanique, chimique ou enzymatique. Une sélection des fragments est réalisée suivant leur taille. La dernière étape consiste en l'ajout d'étiquettes aux...

Contrairement au séquençage Sanger, qui se limite à un seul fragment d'ADN, le séquençage haut débit permet l' acquisition simultanée de données relatives à des millions de fragments d'ADN constituant ce que l'on nomme une librairie. En tant que technologie hautement évolutive, la technologie NGS peut être utilisée pour séquencer le matériel génétique de n'importe quel organisme : Séquençage de génomes encore non référencés (Séquençage De novo) Re-séquençage de génomes référencés, afin de trouver de nouveaux variants génétiques Analyse de transcrits : RNA-Seq Identification de mutations ponctuelles (SNPs), d' insertions ou de délétions de fragments d'ADN Détection de différents organismes (biodiversité) présents dans un échantillon donné (étude du microbiome intestinal par exemple) par l'analyse de séquences cibles Détermination des sites de méthylation de l'ADN Étude des interactions ADN/ARN - protéines ... Il existe plusieurs technologies de séquençage NGS dépendantes du...

Vous concevez des immunothérapies innovantes afin de lutter contre certaines maladies. Vos années de recherche et développement vous ont permis de développer une lignée cellulaire produisant un anticorps spécialement ciblé afin de lutter efficacement contre une maladie. Nous sommes dans la capacité de déterminer les séquences nucléotidiques codant pour les différente chaînes de cet anticorps, vous permettant ainsi de les conserver et de reproduire la molécule d'intérêt, ceci même si votre lignée venait à disparaître. La mise au point en interne de deux méthodologies nous permet de répondre à toutes demandes concernant le séquençage d'anticorps comme par exemple : Le séquençage des régions variables des chaînes légères et constantes La détermination de la séquence de la région "leader" de votre anticorps Le séquençage complet des régions constantes des chaînes lourdes et/ou légères L'analyse de cellules produisant des anticorps polyclonaux ... Méthode par clonage A partir de...

En biologie, les microsatellites de l’ADN sont utilisés comme marqueurs pour construire la carte génétique d'un individu. Ils permettent également de déterminer le degré d'apparentement entre individus ou entre populations, avec un certain niveau de confiance suivant le nombre de microsatellites étudiés. Principe de la méthode Les microsatellites sont constitués de motifs formés de séquences courtes d'ADN (séquences de 1 à 6 paires de bases, par exemple CA) répétées en tandem. Ces séquences d'ADN sont très abondantes dans le génome eucaryote (jusqu'à mille exemplaires pour certains microsatellites). La transmission des microsatellites suit comme pour n'importe quel gène les lois de Mendel de l'hérédité mais des variations peuvent apparaître d'une génération à l'autre. Ces variations portent soit sur le nombre de répétitions du motif (5 à 1000 fois en général, on parle de polymorphisme de taille) et/ou sur la séquence du motif répété (on parle de polymorphisme de structure par...

BIOMNIGENE est avant tout composée d'une équipe spécialisée en biologie moléculaire et cellulaire. Son personnel qualifié peut vous aider à concrétiser vos projets, aussi complexes soient-ils, en élaborant des protocoles expérimentaux adaptés à vos besoins et en recourant à tout un panel de techniques. Biomnigene, grâce à la pluridisciplinarité de son équipe et à la polyvalence de ses équipements, réalisera pour vous : la construction de vecteurs personnalisés des clonages bactériens la synthèse de protéines recombinantes la localisation d'inserts dans vos organismes recombinants des analyses sous microscope telles que la détection de molécules marquées par immunofluorescence... Pour que ces études personnalisées aboutissent et répondent le mieux à vos attentes, un échange régulier entre le chef de projet de BIOMNIGENE et une personne clé de votre équipe de travail est nécessaire.

BIOMNIGENE est capable de répondre à nombre de vos questions et besoins en termes de biologie moléculaire tels que : L’extraction d’ADN/ARN sur tissus, fèces, cellules, bactéries, urine, sang, salive, semence… L’amplification d’ADN par PCR, d’ADNc à partir d’ARN par RT-PCR La quantification de l’expression de gènes par qPCR La purification de produits PCR, de librairies d’ADN, de plasmides La quantification/détection d’ADN, ARN, SNPs, microsatellites Du contrôle qualité ADN / ARN / ADNc, plasmides, librairies d’ADN Le séquençage d’acides nucléiques, de petits génomes (bactéries), d’ARNm, de transcriptomes, de métagénomes, d’exomes par la méthode SANGER ou par technologie haut débit Illumina sur MiSeq et iSeq100. Spécialisée en analyses génomiques, BIOMNIGENE est en mesure, grâce à son savoir-faire à la fois institutionnel et privé, de mettre au point des protocoles expérimentaux de pointe en accord avec les Bonnes Pratiques de Laboratoire.