Préparation de librairies NGS
Descriptif
Le séquençage de nouvelle génération nécessite une préparation soigneuse du matériel génétique en amont de la réaction de séquençage pour garantir des résultats fiables. Le séquençage haut débit est réalisé sur des fragments de taille homogène présentant à leurs extrémités de courtes séquences appelées étiquettes permettant de définir l'origine des fragments lors du séquençage simultanée de plusieurs échantillons, la fixation sur un support solide et l'initialisation de la réaction de séquençage par incorporation de dNTPs marqués. Pour générer ces fragments qui constituent ce que l'on appelle une librairie, il existe différentes approches comme par exemple : La préparation de librairies par fragmentation : le matériel génétique est dans un premier temps découpé en fragments de différentes tailles. La fragmentation peut être mécanique, chimique ou enzymatique. Une sélection des fragments est réalisée suivant leur taille. La dernière étape consiste en l'ajout d'étiquettes aux...
- Microbiologie industrielle
- biologie moleculaire
- préparation librairies NGS
- NGS librairies
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BIOMNIGENE
France
BIOMNIGENE est capable de répondre à nombre de vos questions et besoins en termes de biologie moléculaire tels que : L’extraction d’ADN/ARN sur tissus, fèces, cellules, bactéries, urine, sang, salive, semence… L’amplification d’ADN par PCR, d’ADNc à partir d’ARN par RT-PCR La quantification de l’expression de gènes par qPCR La purification de produits PCR, de librairies d’ADN, de plasmides La quantification/détection d’ADN, ARN, SNPs, microsatellites Du contrôle qualité ADN / ARN / ADNc, plasmides, librairies d’ADN Le séquençage d’acides nucléiques, de petits génomes (bactéries), d’ARNm, de transcriptomes, de métagénomes, d’exomes par la méthode SANGER ou par technologie haut débit Illumina sur MiSeq et iSeq100. Spécialisée en analyses génomiques, BIOMNIGENE est en mesure, grâce à son savoir-faire à la fois institutionnel et privé, de mettre au point des protocoles expérimentaux de pointe en accord avec les Bonnes Pratiques de Laboratoire.
BIOMNIGENE
France
Nous sommes dans la capacité d’extraire le matériel génétique (ADN ou ARN) dont vous avez besoin pour la réalisation de vos analyses à partir de tout type d'échantillon : tissus divers (sang, peau, ...) culots cellulaires (eucaryotes ou procaryotes) prélèvements environnementaux ( eau, terre, …) fèces.... Afin de garantir une extraction optimale, nous utilisons la méthode la plus adaptée suivant le type d'échantillon fourni. Quel que soit la méthode utilisée, les grandes étapes de la préparation sont les suivantes : Lyse : mécanique, chimique ou enzymatique suivant la nature du prélèvement Isolement de l'ADN ou de l'ARN : sur colonne de silice ou par centrifugation différentielle Purification : élution de la colonne après élimination des protéines et autres contaminants Contrôle qualité (optionnel) : dosage par spectrophotométrie ou visualisation du profil électrophorétique sur gel d'agarose. L’ADN ou l’ARN extrait est repris dans de l’eau ultrapure ou du tampon d'élution...
BIOMNIGENE
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BIOMNIGENE est avant tout composée d'une équipe spécialisée en biologie moléculaire et cellulaire. Son personnel qualifié peut vous aider à concrétiser vos projets, aussi complexes soient-ils, en élaborant des protocoles expérimentaux adaptés à vos besoins et en recourant à tout un panel de techniques. Biomnigene, grâce à la pluridisciplinarité de son équipe et à la polyvalence de ses équipements, réalisera pour vous : la construction de vecteurs personnalisés des clonages bactériens la synthèse de protéines recombinantes la localisation d'inserts dans vos organismes recombinants des analyses sous microscope telles que la détection de molécules marquées par immunofluorescence... Pour que ces études personnalisées aboutissent et répondent le mieux à vos attentes, un échange régulier entre le chef de projet de BIOMNIGENE et une personne clé de votre équipe de travail est nécessaire.