NGS
Descriptif
Contrairement au séquençage Sanger, qui se limite à un seul fragment d'ADN, le séquençage haut débit permet l' acquisition simultanée de données relatives à des millions de fragments d'ADN constituant ce que l'on nomme une librairie. En tant que technologie hautement évolutive, la technologie NGS peut être utilisée pour séquencer le matériel génétique de n'importe quel organisme : Séquençage de génomes encore non référencés (Séquençage De novo) Re-séquençage de génomes référencés, afin de trouver de nouveaux variants génétiques Analyse de transcrits : RNA-Seq Identification de mutations ponctuelles (SNPs), d' insertions ou de délétions de fragments d'ADN Détection de différents organismes (biodiversité) présents dans un échantillon donné (étude du microbiome intestinal par exemple) par l'analyse de séquences cibles Détermination des sites de méthylation de l'ADN Étude des interactions ADN/ARN - protéines ... Il existe plusieurs technologies de séquençage NGS dépendantes du...
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BIOMNIGENE
France
Le séquençage de nouvelle génération nécessite une préparation soigneuse du matériel génétique en amont de la réaction de séquençage pour garantir des résultats fiables. Le séquençage haut débit est réalisé sur des fragments de taille homogène présentant à leurs extrémités de courtes séquences appelées étiquettes permettant de définir l'origine des fragments lors du séquençage simultanée de plusieurs échantillons, la fixation sur un support solide et l'initialisation de la réaction de séquençage par incorporation de dNTPs marqués. Pour générer ces fragments qui constituent ce que l'on appelle une librairie, il existe différentes approches comme par exemple : La préparation de librairies par fragmentation : le matériel génétique est dans un premier temps découpé en fragments de différentes tailles. La fragmentation peut être mécanique, chimique ou enzymatique. Une sélection des fragments est réalisée suivant leur taille. La dernière étape consiste en l'ajout d'étiquettes aux...