Laboratoire d'analyse du microbiome

Vos projets de recherche nécessitent de : Quantifier l' expression d'un gène Détecter et estimer la quantité relative d'un pathogène, un virus ... Génotyper à partir de SNPs Détecter et déterminer le nombre de copies d'un gène Contrôler la qualité de vos cocultures et valider un test de production. La PCR en temps réel ou PCR quantitative (qPCR) est une des techniques les plus adaptées pour répondre à ces besoins : dérivée de la PCR, elle permet de détecter, caractériser et quantifier les acides nucléiques pour de nombreuses applications. La qPCR est généralement réalisée à partir d'ADN, mais pour certaines applications spécifiques telles que l' expression de gènes, l'ARN sera utilisé comme support de départ, nous parlons alors de RT-qPCR (Reverse Transcription quantitative PCR). Plus précisément, la PCR en temps réel diffère de la PCR classique par l'utilisation d'un système de marquage permettant de suivre la progression de la réaction. Les données recueillies à chaque cycle...

BIOMNIGENE est capable de répondre à nombre de vos questions et besoins en termes de biologie moléculaire tels que : L’extraction d’ADN/ARN sur tissus, fèces, cellules, bactéries, urine, sang, salive, semence… L’amplification d’ADN par PCR, d’ADNc à partir d’ARN par RT-PCR La quantification de l’expression de gènes par qPCR La purification de produits PCR, de librairies d’ADN, de plasmides La quantification/détection d’ADN, ARN, SNPs, microsatellites Du contrôle qualité ADN / ARN / ADNc, plasmides, librairies d’ADN Le séquençage d’acides nucléiques, de petits génomes (bactéries), d’ARNm, de transcriptomes, de métagénomes, d’exomes par la méthode SANGER ou par technologie haut débit Illumina sur MiSeq et iSeq100. Spécialisée en analyses génomiques, BIOMNIGENE est en mesure, grâce à son savoir-faire à la fois institutionnel et privé, de mettre au point des protocoles expérimentaux de pointe en accord avec les Bonnes Pratiques de Laboratoire.

Nous sommes dans la capacité d’extraire le matériel génétique (ADN ou ARN) dont vous avez besoin pour la réalisation de vos analyses à partir de tout type d'échantillon : tissus divers (sang, peau, ...) culots cellulaires (eucaryotes ou procaryotes) prélèvements environnementaux ( eau, terre, …) fèces.... Afin de garantir une extraction optimale, nous utilisons la méthode la plus adaptée suivant le type d'échantillon fourni. Quel que soit la méthode utilisée, les grandes étapes de la préparation sont les suivantes : Lyse : mécanique, chimique ou enzymatique suivant la nature du prélèvement Isolement de l'ADN ou de l'ARN : sur colonne de silice ou par centrifugation différentielle Purification : élution de la colonne après élimination des protéines et autres contaminants Contrôle qualité (optionnel) : dosage par spectrophotométrie ou visualisation du profil électrophorétique sur gel d'agarose. L’ADN ou l’ARN extrait est repris dans de l’eau ultrapure ou du tampon d'élution...

Détection d'organismes dans les prélèvements